日本バプテスト連盟理事会は２０１８年12月18日、政府が12月14日に開始した辺野古新基地建設作業に伴う大浦への土砂投入に強く抗議し、同作業の即時中止を求める抗議声明を、安倍晋三内閣総理大臣、岩屋毅防衛大臣に向けて出した。
声明では、「沖縄県民の辺野古新基地建設反対の民意はすでに、18年９月30日の県知事選での玉城デニー氏の圧勝で明確に示されているにも関わらず、防衛省は違法な行政不服審査請求と執行停止申し立てを行い、同じ政府内の国交相がこれを承認、効力の一時停止を発表した」とし、「今回の工事開始、土砂投入は、民意を無視し踏みにじった違法な手続きの中で行われたもので断じて許せない」と抗議。「わたしたちは平和の主イエス･キリストに従って教会を形成する者たちとして、国家によるこの破壊暴力を認めない」とした。
